Ajan Ethan Hunt, emekli olmuştur ve artık yeni ajan adaylarının eğitiminde görev almaktadır. Ancak tehlikeli bir silah satıcısı olan Owen Davian, Hunt’ın eğittiği ajanlardan birini kaçırınca, Hunt onu kurtarmak için ekibini bir araya getirir. Owen, ajanı öldürür. Hunts ve ekibi, intikam için Vatikan’a doğru yola çıkar.
Ethan Hunt ve IMF ekibi şimdiye kadarki en tehlikeli görevlerine atılıyorlar. Görevleri; yanlış ellere geçmeden önce tüm insanlığı tehdit eden korkunç bir silahın izini sürmek. Geleceğin kontrolü ve dünyanın kaderi tehlikedeyken ve Ethan'ın geçmişinden gelen karanlık güçler yaklaşırken, dünya çapında ölümcül bir yarış başlıyor. Gizemli, her şeye gücü yeten bir düşmanla karşı karşıya kalan Ethan, hiçbir şeyin görevinden daha önemli olamayacağını düşünmek zorunda kalır. En çok değer verdiği kişilerin hayatları bile.
Ethan Hunt, birlikte çalıştığı IMF ekibi ve birkaç dostuyla beraber sıkıntılı bir sürecin içindedir. Berlin'deki görevin ters gitmesi sonucunda CIA ile ters düşen Ethan Hunt, denetimsizliği sebebiyle kara listeye alınır. Ancak insanlığı tehdit eden yeni bir tehlikenin ortaya çıkmasıyla herkes zamana karşı bir yarışa girecektir.
911 acil çağrı merkezi operatörü olan Pamela’nın kızı ve polis kocası, gizemli bir adam tarafından kaçırılarak rehine olarak tutulur. Adam, polisten şehirdeki tüm polis ve itfaiye birimlerine anonslar yaparak belli merkezlere yönlendirmesini ister. Şehir tarihinin en büyük suçu işlenirken Pamela, zamana karşı yarışmaktadır. Kocasının ise karşısında iki seçenek vardır; ya kızını, ya da şehri kurtaracaktır.
